Para Ilmuwan Membangun Pemodelan AI Untuk Memahami Lebih Banyak Tentang Struktur Protein – Gula

oleh -17 views
ai
Photo by Amanda Dalbjörn on Unsplash

ZETIZEN RADAR CIREBON – Pembangunan penelitian baru pada algoritme AI telah memungkinkan para ilmuwan untuk membuat model yang lebih lengkap dari struktur protein dalam tubuh kita — membuka jalan bagi desain terapi dan vaksin yang lebih cepat. (Dheva)

Studi yang di pimpin oleh University of York menggunakan kecerdasan buatan (AI) untuk membantu para peneliti memahami lebih banyak tentang gula yang mengelilingi sebagian besar protein dalam tubuh kita.

Hingga 70 persen protein manusia di kelilingi atau di rangkai dengan gula, yang memainkan peran penting dalam penampilan dan tindakannya. Selain itu, beberapa virus seperti yang ada di balik AIDS, Flu, Ebola, dan COVID-19 juga terlindung di balik gula (glycans). Penambahan gula ini di kenal sebagai modifikasi.

Untuk mempelajari protein, peneliti membuat perangkat lunak yang menambahkan komponen gula yang hilang ke model yang di buat dengan AlphaFold. Yang merupakan program kecerdasan buatan yang di kembangkan oleh DeepMind Google yang melakukan prediksi struktur protein.

Kemudian Penulis senior, Dr Jon Agirre dari Departemen Kimia mengatakan: “Protein tubuh manusia adalah mesin kecil yang jumlahnya miliaran, membentuk daging dan tulang kita. Mengangkut oksigen kita, Memungkinkan kita berfungsi, dan melindungi kita dari patogen. Dan seperti palu yang bergantung pada kepala logam untuk memukul benda runcing termasuk paku, protein memiliki bentuk dan komposisi khusus untuk menyelesaikan pekerjaannya.”

“Metode AlphaFold untuk prediksi struktur protein memiliki potensi untuk merevolusi alur kerja dalam biologi, memungkinkan para ilmuwan untuk memahami protein dan dampak mutasi lebih cepat dari sebelumnya.”

“Namun, algoritme tidak memperhitungkan modifikasi penting yang memengaruhi struktur dan fungsi protein, yang memberi kita hanya sebagian dari gambarannya. Penelitian kami telah menunjukkan bahwa ini dapat di atasi dengan cara yang relatif mudah. Yang mengarah ke prediksi struktural yang lebih lengkap. “

Pengenalan AlphaFold baru-baru ini dan database struktur protein yang menyertainya telah memungkinkan para ilmuwan untuk memiliki prediksi struktur yang akurat untuk semua p rotein manusia yang di ketahui.

Dr Agirre menambahkan: “Selalu menyenangkan untuk menyaksikan kolaborasi internasional tumbuh dan membuahkan hasil, tetapi ini baru permulaan bagi kami. Perangkat lunak kami di gunakan dalam pekerjaan struktural glikan yang menopang vaksin mRNA melawan SARS-CoV-2. Tetapi sekarang ada banyak lagi yang bisa kita lakukan berkat lompatan teknologi AlphaFold. Ini masih tahap awal, tetapi tujuannya adalah untuk beralih dari bereaksi terhadap perubahan perisai glikan menjadi mengantisipasinya.”

Penelitian ini di lakukan bersama Dr Elisa Fadda dan Carl A. Fogarty dari Maynooth University. Haroldas Bagdonas, mahasiswa PhD di York Structural Biology Laboratory, yang merupakan bagian dari Departemen Kimia, juga mengerjakan penelitian ini bersama Dr Agirre.

Sumber : Materi di sediakan oleh University of York.

Journal Reference:

  1. Haroldas Bagdonas, Carl A. Fogarty, Elisa Fadda, Jon Agirre. The case for post-predictional modifications in the AlphaFold Protein Structure DatabaseNature Structural & Molecular Biology, 2021; DOI: 10.1038/s41594-021-00680-9

Baca juga : Studi Baru Menguji Persepsi Privasi Dan Keamanan Dari Layanan Pengawasan Pendidikan Online

Tinggalkan Balasan

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Ruas yang wajib ditandai *